1. Кернохранилище - заместитель директора Амшинский А.Н.
1.1. Отдел "Обработки и хранения материальных носителей первичной геологической информации" - Гасанов О. Г.
1.2. Сектор «Информационно-методического сопровождения» - Клавдиева Н.В.
1.3. Сектор «Палеонтологических коллекций» - Савельева Ю. Н.


2. Научно-Аналитический центр - заместитель директора Асташкин Д.А.
2.1. Сектор «Метрологии и аккредитации» - Ортман О.Р.
2.2. Лаборатория органической геохимии - Пайзанская И.Л.
2.3. Лаборатория петрофизики - Капранова Е.А.
2.4. Лаборатория потоковых исследований - Звездов А.В.
2.5. Шлифовальная мастерская - Мертвецов Д.Н.
2.6. Лаборатория «Седиментологии и литологических коллекций»

3. Энергетический участок - Магон А. Н.

4. Механический участок - Клюев П. В.

5. Автотранспортный участок

6. Отдел «По эксплуатации административных и бытовых объектов» - Касина Т. В.

7. Сектор «По обеспечению безопасности объектов» - Моргунов А. Д.

8. Сектор «Гостиничных услуг» - Нижник М. Я.