1. Кернохранилище - заместитель директора Амшинский А.Н.
1.1. Сектор хранения материальных носителей первичной геологической информации - Бортник Р.С.
1.2. Сектор информационно-методического сопровождения - Клавдиева Н.В.
1.3. Сектор обработки кернового материала
1.4. Сектор литологических коллекций - Фомин А.С.
1.5. Сектор палеонтологических коллекций - Савельева Ю.Н.

2. Научно-Аналитический центр - заместитель директора Асташкин Д.А.
2.1. Отдел Геохимические методы прогноза нефтегазоносности и охраны окружающей среды - Дахнова М.В.
2.2. Лаборатория органической геохимии - Пайзанская И.Л.
2.3. Лаборатория петрофизики - Капранова Е.А.
2.4. Лаборатория литологии - Агафонова Г.В.
2.5. Лаборатория потоковых исследований - Звездов А.В.
2.6. Шлифовальная мастерская - Борисов В.В.