Основной целью деятельности филиала является информационно-аналитическое, опытно-методическое и практическое обеспечение и сопровождение государственного геологического изучения недр, воспроизводства минерально-сырьевой базы и государственной системы лицензирования пользования недрами, выполнение работ по государственному геологическому изучению недр на УВС, выполнение работ по геологическому информационному обеспечению, научно-техническое обеспечение геологоразведочных работ.
Филиал осуществляет свою деятельность на территории Южного и Северо-Кавказского федеральных округов. В определенных случаях, на основании приказа ФГБУ «ВНИГНИ» - на отдельных территориях Российской Федерации при выполнении работ на объектах регионального геологического изучения.